Ekstrakcja DNA/RNA

Jak działa ekstrakcja DNA/RNA?

Jako ważny etap przygotowawczy, właściwa homogenizacja i wzbogacenie próbki zapewnia, że materiał testowy jest odpowiednio przygotowany i skoncentrowany do skutecznej ekstrakcji DNA/RNA.

1. Liza: Proces ekstrakcji DNA/RNA rozpoczyna się od lizy (lizy komórek w przypadku ekstrakcji DNA lub lizy cząsteczek wirusa w przypadku ekstrakcji RNA), kluczowego etapu, w którym komórki lub cząsteczki w próbce są rozbijane w celu uwolnienia ich kwasów nukleinowych. Można to osiągnąć różnymi metodami, w tym obróbką enzymatyczną (przy użyciu enzymów, takich jak proteinaza K), mechanicznym rozerwaniem (takim jak ubijanie kulek lub homogenizacja) lub środkami chemicznymi (takimi jak detergenty lub roztwory alkaliczne). Celem lizy jest skuteczne przerwanie błony komórkowej, ściany komórkowej lub cząsteczki wirusa, umożliwiając uwolnienie kwasu nukleinowego (DNA lub RNA) zawartego w komórkach do roztworu. Ten krok jest niezbędny do uzyskania dostępu do materiału genetycznego niezbędnego do dalszej analizy.
2. Opcjonalnie: Oczyszczanie ekstraktu: Po lizie ekstrakt często zawiera mieszaninę kwasów nukleinowych wraz z białkami, lipidami i innymi resztkami komórkowymi. Oczyszczanie ekstraktu jest opcjonalnym, ale ważnym krokiem, który izoluje DNA lub RNA od tych zanieczyszczeń, zapewniając, że kwasy nukleinowe mają wysoką czystość i nadają się do dokładnych badań molekularnych. Oczyszczanie można przeprowadzić przy użyciu różnych metod, takich jak wiązanie kwasów nukleinowych ze stałą matrycą (tj. kolumnami krzemionkowymi), wytrącanie ich alkoholem lub stosowanie kulek magnetycznych. Oczyszczony ekstrakt jest następnie płukany w celu usunięcia wszelkich pozostałości zanieczyszczeń i ostatecznie eluowany w buforze lub wodzie, pozostawiając czystą próbkę DNA lub RNA gotową do dalszej analizy. Krok ten jest szczególnie ważny w przypadku przeprowadzania reakcji PCR w czasie rzeczywistym ze złożonych ekstraktów, takich jak komórki eukariotyczne, które wymagają bardzo czystych kwasów nukleinowych w celu uzyskania precyzyjnych i wiarygodnych wyników.

Korzyści z dostosowanej ekstrakcji DNA/RNA do wykrywania metodą PCR w czasie rzeczywistym

Dostosowane metody ekstrakcji DNA/RNA oferują kilka krytycznych korzyści w zakresie wykrywania zanieczyszczeń i zapewniania bezpieczeństwa próbek żywności i próbek środowiskowych przy użyciu PCR w czasie rzeczywistym.

• Zoptymalizowane dla różnych typów próbek: Próbki żywności i próbki środowiskowe mogą różnić się znacznie pod względem składu, co wymaga specjalistycznych metod ekstrakcji, aby skutecznie obsługiwać różne matryce. Dostosowane metody ekstrakcji DNA/RNA są zaprojektowane do wydajnej pracy z szerokim zakresem typów próbek, zapewniając, że niezależnie od tego, czy badają Państwo złożony produkt spożywczy, czy powierzchnię środowiskową, można niezawodnie wyodrębnić kwasy nukleinowe potrzebne do dokładnej analizy PCR.
• Zwiększona wydajność i spójność: Niestandardowe rozwiązania do ekstrakcji usprawniają przepływ pracy, zmniejszając ryzyko błędów i zapewniając spójne wyniki w wielu testach i typach próbek. Zwiększona wydajność zapewnia niezawodność i powtarzalność procesów testowania, co jest niezbędne do utrzymania wysokich standardów bezpieczeństwa i jakości.
• Kompatybilność ze zautomatyzowanymi systemami: Ponieważ laboratoria badawcze coraz częściej decydują się na automatyzację w celu poprawy wydajności i ograniczenia pracy ręcznej, dostosowane metody ekstrakcji DNA/RNA można zaprojektować tak, aby płynnie integrowały się ze zautomatyzowanymi systemami PCR. Kompatybilność ta pozwala na przetwarzanie o wysokiej wydajności, skracając czas i wysiłek wymagany do przygotowania próbki przy jednoczesnym zachowaniu dokładności i wiarygodności wyników.

Odpowiednia metoda ekstrakcji DNA/RNA dla Państwa procesu detekcji

Wybór odpowiedniej metody ekstrakcji DNA/RNA ma kluczowe znaczenie dla spełnienia specyficznych potrzeb Państwa procesów badawczych. Potrzeby klientów mogą się znacznie różnić, wymagając dostosowanych rozwiązań, które oferują wygodę, wiarygodne wyniki i potencjał automatyzacji. Niezależnie od tego, czy mają Państwo do czynienia z rutynowymi testami, czy też potrzebują Państwo metody, która płynnie integruje się ze zautomatyzowanym przepływem pracy, odpowiednia metoda ekstrakcji zapewni dokładne i wydajne przygotowanie próbki.

Różne matryce testowe, takie jak złożone produkty spożywcze lub próbki środowiskowe, mogą stanowić poważne wyzwanie podczas ekstrakcji. Matryce te mogą znacznie różnić się składem, co wymaga specjalistycznych metod skutecznego rozbijania komórek i izolowania kwasów nukleinowych. Dostosowane rozwiązania ekstrakcyjne są zaprojektowane do obsługi tych trudnych matryc, zapewniając, że nawet najbardziej wymagające próbki dają wysokiej jakości DNA lub RNA do wiarygodnej analizy PCR.

Wybierając odpowiednią metodę ekstrakcji, mogą Państwo zoptymalizować procesy testowania, zmniejszyć potencjalne błędy i zapewnić, że wyniki będą niezmiennie dokładne, niezależnie od rodzaju próbki. Zestawy do wykrywania ^BAX® System są wyposażone w zintegrowaną metodę lizy, umożliwiającą bezpośrednie wykorzystanie ekstraktu w przebiegu PCR w czasie rzeczywistym. Zestawy do wykrywania ^Foodproof® oferują szereg specjalistycznych etapów ekstrakcji, aby spełnić określone potrzeby klientów, takie jak izolacja o wysokiej czystości, ręczne procedury o wysokiej wydajności lub w pełni zautomatyzowane procedury testowe.

Zestawy foodproof mogą być stosowane, gdy ważna jest izolacja o wysokiej czystości, np. w przypadku trudnych matryc, takich jak czekolada, które mogą zakłócać PCR, lub jako dodatkowy etap weryfikacji, gdy wyniki innych testów PCR nie są jasne.

System BAX: Zintegrowana ekstrakcja DNA dla szybkiego i wygodnego wykrywania patogenów

Protokoły PCR w czasie rzeczywistym BAX System obejmują etap zoptymalizowanej, indukowanej ciepłem lizy ścian komórkowych patogenów, umożliwiając bezpośrednie wykorzystanie ekstraktu w reakcji PCR.

odporna na żywność ekstrakcja DNA/RNA: Procedury oczyszczania dostosowane do konkretnych potrzeb klienta

Linia produktów foodproof wykorzystuje modułowe podejście, które pozwala użytkownikowi wybrać optymalne rozwiązanie dla każdego etapu procedury testowania PCR w czasie rzeczywistym dla próbek żywności i próbek środowiskowych. W przeciwieństwie do zestawów BAX System, procedura foodproof oddziela ekstrakcję DNA/RNA od etapu wykrywania PCR w czasie rzeczywistym, aby zapewnić specjalistyczne rozwiązania dla każdej potrzeby klienta. Aby umożliwić zestawom foodproof real-time PCR nie tylko wykrywanie mikroorganizmów, ale także wykrywanie wirusów i alergenów, identyfikację gatunków zwierząt oraz przesiewanie i identyfikację GMO, wiele zestawów do ekstrakcji foodproof zostało zaprojektowanych do specjalistycznych zastosowań:

Kluczowe wnioski dotyczące ekstrakcji DNA/RNA

• Właściwa ekstrakcja DNA/RNA jest kluczowym etapem przygotowawczym dla uzyskania wiarygodnych wyników testów opartych na PCR w czasie rzeczywistym
• Nasze linie produktów oferują opcje dla różnych metod ekstrakcji DNA/RNA dla szerokiej gamy matryc.
• Wiele certyfikowanych i zwalidowanych testów innych firm

Linia produktów ^BAX® System

• Liza komórek/izolacja DNA jest zintegrowanym krokiem w każdym teście BAX System PCR.
• Może być stosowany do szybkiego i wygodnego wykrywania patogenów w szerokiej gamie matryc.
• Zaprojektowany zarówno do ilościowego, jak i jakościowego wykrywania patogenów w szerokiej gamie matryc spożywczych.
• Zatwierdzone testy do ilościowego oznaczania kluczowych patogenów, takich jak Salmonella, Campylobacter, Listeria i E. coli.
• Kompatybilny z półautomatycznym przetwarzaniem przy użyciu ^Hygiena® Prep Express

Linia produktów ^foodproof

• Ekstrakcja DNA/RNA jest oddzielnym etapem z dodatkowymi zestawami do ekstrakcji dostosowanymi do konkretnych potrzeb klienta.
  • Foodproof StarPrep Kits: do oczyszczania DNA z bakterii (patogenów i organizmów powodujących psucie się żywności) w celu uzyskania niskiej lub wysokiej wydajności ręcznego pobierania próbek.
  • foodproof Sample Preparation Kits: do oczyszczania DNA z komórek eukariotycznych (do wykrywania alergenów, badań przesiewowych i identyfikacji GMO, identyfikacji zwierząt) oraz oczyszczania RNA (do wykrywania wirusów)
  • Foodproof Magnetic Preparation Kits: do półautomatycznego i w pełni zautomatyzowanego oczyszczania DNA przy użyciu stacji roboczych RoboPrep® Series.
• Mogą być stosowane jako dodatkowy etap weryfikacji, gdy wyniki testów z użyciem zestawów BAX System nie są jednoznaczne.
• Powinny być stosowane, gdy ważna jest izolacja o wysokiej czystości, np. próbki zawierające składniki hamujące PCR.