DNA/RNA-Extraktion

Wie funktioniert die DNA/RNA-Extraktion?

Ein wichtiger vorbereitender Schritt ist die ordnungsgemäße Homogenisierung und Anreicherung der Probe, um sicherzustellen, dass das Testmaterial für eine effektive DNA/RNA-Extraktion angemessen vorbereitet und konzentriert ist.

1. Lysis: Der Prozess der DNA/RNA-Extraktion beginnt mit der Lyse (entweder Zelllyse für die DNA-Extraktion oder Viruspartikellyse für die RNA-Extraktion), einem entscheidenden Schritt, bei dem die Zellen oder Partikel in der Probe aufgebrochen werden, um ihre Nukleinsäuren freizusetzen. Dies kann durch verschiedene Methoden erreicht werden, z. B. durch enzymatische Behandlung (mit Enzymen wie Proteinase K), mechanische Aufbrechung (z. B. durch Klopfen auf Perlen oder Homogenisierung) oder chemische Mittel (z. B. Detergenzien oder Laugenlösungen). Das Ziel der Lyse ist es, die Zellmembran, die Zellwand oder das Viruspartikel effektiv zu zerstören, so dass die in den Zellen enthaltene Nukleinsäure (DNA oder RNA) in die Lösung freigesetzt werden kann. Dieser Schritt ist wichtig, um an das genetische Material zu gelangen, das für die nachfolgende Analyse benötigt wird.
2. Optional: Aufreinigung des Extrakts: Nach der Lyse enthält der Extrakt oft eine Mischung aus Nukleinsäuren sowie Proteinen, Lipiden und anderen Zelltrümmern. Die Aufreinigung des Extrakts ist ein optionaler, aber wichtiger Schritt, der die DNA oder RNA von diesen Verunreinigungen isoliert und sicherstellt, dass die Nukleinsäuren von hoher Reinheit und für genaue molekulare Tests geeignet sind. Die Reinigung kann mit verschiedenen Methoden erfolgen, z.B. durch Bindung der Nukleinsäuren an eine feste Matrix (z.B. Kieselgelsäulen), durch Ausfällung mit Alkohol oder durch Verwendung magnetischer Kügelchen. Der gereinigte Extrakt wird dann gewaschen, um restliche Verunreinigungen zu entfernen, und schließlich in einem Puffer oder Wasser eluiert, so dass eine saubere DNA- oder RNA-Probe für die weitere Analyse zur Verfügung steht. Dieser Schritt ist besonders wichtig, wenn Sie Downstream-Echtzeit-PCR-Reaktionen aus komplexen Extrakten, wie z. B. eukaryotischen Zellen, durchführen, die hochreine Nukleinsäuren für präzise und zuverlässige Ergebnisse erfordern.

Vorteile der maßgeschneiderten DNA/RNA-Extraktion für den Nachweis mit Real-Time PCR

Maßgeschneiderte DNA/RNA-Extraktionsmethoden bieten mehrere entscheidende Vorteile für den Nachweis von Verunreinigungen und die Gewährleistung der Sicherheit von Lebensmittel- und Umweltproben unter Verwendung von Echtzeit-PCR.

• Optimiert für verschiedene Probentypen: Lebensmittel- und Umweltproben können in ihrer Zusammensetzung sehr unterschiedlich sein, so dass spezielle Extraktionsmethoden erforderlich sind, um verschiedene Matrices effektiv zu verarbeiten. Maßgeschneiderte DNA/RNA-Extraktionsmethoden sind so konzipiert, dass sie mit einem breiten Spektrum von Probentypen effizient arbeiten. So können Sie sicherstellen, dass Sie die für eine genaue PCR-Analyse benötigten Nukleinsäuren zuverlässig extrahieren können, ganz gleich, ob Sie ein komplexes Lebensmittelprodukt oder eine Umweltoberfläche testen.
• Erhöhte Effizienz und Konsistenz: Maßgeschneiderte Extraktionslösungen rationalisieren Ihre Arbeitsabläufe, indem sie das Fehlerpotenzial verringern und konsistente Ergebnisse bei verschiedenen Tests und Probentypen gewährleisten. Diese erhöhte Effizienz stellt sicher, dass Ihre Testverfahren zuverlässig und reproduzierbar sind, was für die Aufrechterhaltung hoher Sicherheits- und Qualitätsstandards unerlässlich ist.
• Kompatibilität mit automatisierten Systemen: Da Testlabore zunehmend auf Automatisierung setzen, um den Durchsatz zu erhöhen und die manuelle Arbeit zu reduzieren, können maßgeschneiderte DNA/RNA-Extraktionsmethoden so konzipiert werden, dass sie sich nahtlos in automatisierte PCR-Systeme integrieren lassen. Diese Kompatibilität ermöglicht eine Verarbeitung mit hohem Durchsatz, wodurch der Zeit- und Arbeitsaufwand für die Probenvorbereitung reduziert wird und die Genauigkeit und Zuverlässigkeit Ihrer Ergebnisse erhalten bleibt.

Die richtige DNA/RNA-Extraktionsmethode für Ihren Detektions-Workflow

Die Auswahl der geeigneten DNA/RNA-Extraktionsmethode ist entscheidend für die Erfüllung der spezifischen Anforderungen Ihrer Testverfahren. Die Bedürfnisse der Kunden können sehr unterschiedlich sein und erfordern maßgeschneiderte Lösungen, die Komfort, zuverlässige Ergebnisse und die Möglichkeit zur Automatisierung bieten. Ganz gleich, ob Sie mit Routinetests zu tun haben oder eine Methode benötigen, die sich nahtlos in einen automatisierten Arbeitsablauf einfügt, die richtige Extraktionsmethode gewährleistet eine genaue und effiziente Probenvorbereitung.

Unterschiedliche Testmatrizen, wie z.B. komplexe Lebensmittelprodukte oder Umweltproben, können bei der Extraktion erhebliche Herausforderungen darstellen. Diese Matrices können in ihrer Zusammensetzung stark variieren und erfordern spezielle Methoden, um die Zellen effektiv aufzuspalten und die Nukleinsäuren zu isolieren. Maßgeschneiderte Extraktionslösungen wurden für diese schwierigen Matrices entwickelt und stellen sicher, dass selbst die schwierigsten Proben hochwertige DNA oder RNA für eine zuverlässige PCR-Analyse liefern.

Durch die Wahl der richtigen Extraktionsmethode können Sie Ihre Testverfahren optimieren, potenzielle Fehler reduzieren und sicherstellen, dass Ihre Ergebnisse unabhängig von der Art der Probe durchweg präzise sind. Die BAX^® System Detektionskits werden mit einer integrierten Lysemethode geliefert, die die direkte Verwendung des Extrakts im Echtzeit-PCR-Lauf ermöglicht. Die foodproof^® Detektionskits bieten eine Vielzahl von spezialisierten Extraktionsschritten, um bestimmte Kundenbedürfnisse wie hochreine Isolierung, manuelle Hochdurchsatz- oder vollautomatische Testverfahren zu erfüllen.

Die foodproof Kits können verwendet werden, wenn eine hochreine Isolierung wichtig ist, z.B. bei schwierigen Matrices wie Schokolade, die die PCR stören können, oder als zusätzlicher Verifizierungsschritt, wenn die Ergebnisse anderer PCR-Assays nicht eindeutig sind.

BAX System: Integrierte DNA-Extraktion für den schnellen und bequemen Nachweis von Krankheitserregern

Die Echtzeit-PCR-Protokolle des BAX Systems enthalten einen Schritt zur optimierten hitzeinduzierten Lyse der Zellwände von Pathogenen, der die direkte Verwendung des Extrakts in der PCR-Reaktion ermöglicht.

foodproof DNA/RNA-Extraktion: Maßgeschneiderte Aufreinigungsverfahren für spezifische Kundenbedürfnisse

Die foodproof-Produktlinie verwendet einen modularen Ansatz, der es dem Benutzer ermöglicht, die optimale Lösung für jeden Schritt des Echtzeit-PCR-Testverfahrens für Lebensmittel- und Umweltproben zu wählen. Im Gegensatz zu den Kits des BAX Systems trennt das foodproof-Verfahren die DNA/RNA-Extraktion vom Schritt der Real-Time-PCR-Detektion, um spezialisierte Lösungen für jeden Kundenbedarf zu bieten. Damit die foodproof Echtzeit-PCR-Kits nicht nur Mikroorganismen, sondern auch Viren und Allergene nachweisen, Tierarten identifizieren und GVOs screenen und identifizieren können, sind die verschiedenen foodproof-Extraktionskits für spezielle Anwendungen konzipiert:

Wichtige Erkenntnisse für die DNA/RNA-Extraktion

• Die richtige DNA/RNA-Extraktion ist ein entscheidender Vorbereitungsschritt für verlässliche Ergebnisse von real-time PCR-basierten Tests.
• Unsere Produktlinien bieten Optionen für verschiedene DNA/RNA-Extraktionsmethoden für eine Vielzahl von Matrices
• Mehrere von Dritten zertifizierte und validierte Assays

Die Produktlinie BAX^® System

• Zelllyse/DNA-Isolierung ist ein integrierter Schritt in jedem BAX System PCR-Assay
• Kann für den schnellen und bequemen Nachweis von Krankheitserregern in einer Vielzahl von Matrices verwendet werden
• Entwickelt für den quantitativen und qualitativen Nachweis von Krankheitserregern in einer Vielzahl von Lebensmittelmatrices
• Validierte Assays für die Quantifizierung der wichtigsten Krankheitserreger wie Salmonella, Campylobacter, Listeria und E. coli
• Kompatibel mit der halbautomatischen Verarbeitung mit Hygiena^® Prep Express

Die foodproof^® Produktlinie

• Die DNA/RNA-Extraktion ist ein separater Schritt mit zusätzlichen Extraktionskits, die auf spezifische Kundenbedürfnisse zugeschnitten sind
  • foodproof StarPrep Kits: für die maßgeschneiderte DNA-Aufreinigung aus Bakterien (Krankheitserreger und Verderbniserreger) für einen geringen bis hohen manuellen Probendurchsatz
  • foodproof Sample Preparation Kits: für die maßgeschneiderte DNA-Aufreinigung aus eukaryotischen Zellen (für Allergennachweis, GMO-Screening und -Identifizierung, Tieridentifizierung) und RNA-Aufreinigung (für Virusnachweis)
  • foodproof Magnetic Preparation Kits: für die halb- und vollautomatische DNA-Aufreinigung mit den Workstations der RoboPrep®-Serie
• Kann als zusätzlicher Verifizierungsschritt verwendet werden, wenn die Testergebnisse mit den Kits des BAX Systems nicht eindeutig sind
• Sollte verwendet werden, wenn eine hochreine Isolierung wichtig ist, z. B. bei Proben mit PCR-hemmenden Komponenten