Wyjaśnione przez ekspertów: 5 najważniejszych wskazówek dotyczących kwantyfikacji, które muszą Państwo znać

Witamy w pierwszej serii "Wyjaśnione przez ekspertów" z globalnym menedżerem produktu MDx, April Englishbey.

Przejdźmy od razu i dowiedzmy się więcej o kwantyfikacji.

"Byłam na pokładzie kwantyfikacji i komercyjnie wprowadziłam na rynek pierwszą metodę kwantyfikacji (lub zestaw) SalQuant ™ i towarzyszyłam jej przez cały czas. Chciałem więc podzielić się z Państwem pewnymi doświadczeniami i atrybutami jako klient, czego należy szukać, aby zapytać dostawcę o kwantyfikację.

Jako osoba z praktycznym doświadczeniem w opracowywaniu kwantyfikacji dla branży, chciałem podzielić się krytycznymi elementami, które bierzemy pod uwagę, gdy rozpoczynamy opracowywanie dowolnego rodzaju kwantyfikacji, a także tym, jak działa ona dla branży, aby ostatecznie osiągnąć cel zmniejszenia ryzyka dla konsumentów."

Wskazówka 1

"Najważniejsza jest elastyczność danych. W przypadku danych, które chcą Państwo przechwycić i wykorzystać, proszę zastanowić się, co tak naprawdę chcą Państwo wiedzieć? Jeśli otrzymają Państwo wynik 5,7 CFU/g, to w jaki sposób wykorzystają go Państwo jako narzędzie decyzyjne? Jest to część konsultacji, przez które przechodzimy z klientami, aby dotrzeć do źródła tego, w jaki sposób należy wykorzystać dodatkowe informacje".

Znajomość odpowiedzi na te pytania pomaga zdecydować, który z dwóch rodzajów kwantyfikacji jest Państwu potrzebny w oparciu o elastyczność i cel danych.

1. Prawdziwa kwantyfikacja, taka jak SalQuant, wykorzystuje zidentyfikowany punkt czasowy inkubacji w połączeniu z oprogramowaniem do określenia liczby bakterii w oryginalnej próbce.
2. Testy limitów po prostu identyfikują, kiedy wynik dodatni występuje w określonym punkcie czasowym, wskazując, że liczba bakterii jest większa niż ustalony próg. Czasami ten styl testowania jest również znany jako półilościowy, ale testy graniczne i progowe są nieco mniej mylące.

Naprawdę ważne jest zrozumienie, jakiego rodzaju danych Państwo szukają i w jaki sposób podejmą Państwo decyzję na podstawie tych danych! Czy metoda, z której Państwo korzystają, jest elastyczna i pozwala na wykorzystanie pojedynczej próbki lub protokołu do przeprowadzenia testów ilościowych lub granicznych?

Wskazówka 2

"Drugim narzędziem są opcje dynamicznej matrycy.

Bezpieczeństwo żywności to nie tylko produkty końcowe - w większości przypadków to właśnie na tych próbkach skupiamy się najbardziej. Jednak przetwarzanie i wstępne zbiory są również częścią równania, o które należy się martwić, aby zarządzać całym obszarem bezpieczeństwa żywności.

Kiedy rozpoczęliśmy tę podróż 3 lata temu, najpierw opracowaliśmy kwantyfikację dla produktów końcowych i zebraliśmy świetne dane, ALE nadal musieliśmy dowiedzieć się, dlaczego bakterie nadal przetrwały po wszystkich interwencjach zastosowanych w całym procesie.

Jeśli uda nam się oczyścić pierwszy etap produkcji zwierzęcej i spożywczej, mamy większą szansę na usunięcie salmonelli w całym procesie i zmniejszenie tego ryzyka. Właśnie dlatego widzimy, że branże i wpływowe podmioty nie tylko gromadzą dane z produktu końcowego, ale dodają spójne punkty danych w swoich procesach i naprawdę oceniają, czy interwencje działają. Kontynuowaliśmy również pracę wstecz do poziomu gospodarstwa lub przed zbiorami, aby zmierzyć, gdzie możemy wpłynąć na obciążenie salmonellą, która wchodzi i wychodzi".

Poszukiwanie dostawców, którzy mają solidną metodę do pracy z różnymi matrycami, a nawet brudnymi próbkami, takimi jak rehang i popłuczyny po schłodzeniu, oba są nadal popłuczynami, ale weryfikacja metody działa ze względu na charakter "zabrudzenia".

Nie wszystkie próbki są sobie równe, nawet jeśli wyglądają podobnie, więc upewnienie się, że przeprowadzono weryfikację, jest ważne, aby samemu zobaczyć dane.

Wskazówka 3

"Numer trzy to szerszy zakres wyliczania.

Metody muszą być w stanie dotrzeć zarówno do dolnego (1 CFU), jak i górnego (10 000 CFU) zakresu kwantyfikacji, ponieważ potrzebujemy elastyczności w zależności od rodzaju próbki, a także w przypadku krytycznej awarii, która ma miejsce, gdy bakterie wymykają się spod kontroli".

W ramach programów bezpieczeństwa żywności wiemy, że czasami wystąpi wartość odstająca (niska lub wysoka), a metoda musi być w stanie określić ilościowo w porównaniu do zgłaszania ujemnego lub większego niż wyliczalny zakresu, co nie jest pomocnym punktem danych.

"Lubię używać przykładu płukania, jak wspomniałem we wskazówce 2, do kontroli procesu, aby spojrzeć od brudnego do czystego. Możliwość ilościowego określenia, że przed interwencją występuje duża liczba bakterii, a następnie po interwencji nadal występuje wynik dodatni, ale w bardzo niskiej ilości, wiedząc, że jest on nadal wykrywalny i możliwy do określenia ilościowego, jest ważna dla prawdziwego pomiaru skuteczności procesu i interwencji".

Naprawdę ważne jest, aby zrozumieć, że oczekiwanie od produktu końcowego jest najczystsze i przez większość czasu wolne od patogenów. Wyniki nie powinny być na wysokich poziomach, takich jak 100 CFU/g lub ml. Nawet 10 CFU/g może być zbyt wysokie w zależności od branży. Metody, które mają dolną granicę kwantyfikacji tylko 100 CFU/g, naprawdę nie są pomocne w produkcie końcowym, ponieważ użytkownik będzie miał fałszywe poczucie "czystości", gdy kwantyfikacja będzie postrzegana jako ujemna.

Wskazówka 4

"Czwartą wskazówką jest to, że proces powinien być łatwy w użyciu".

Z perspektywy regulacyjnej częstość występowania zawsze będzie kluczowym elementem pomiaru ryzyka dla konsumentów, a kwantyfikacja nie ma na celu pełnego zastąpienia częstości występowania. Jest to raczej wartość dodana. Myśląc o procesie spełniania potrzeb regulacyjnych, ale także gromadzenia większej ilości informacji, wykorzystanie tej samej próbki w całym procesie jest naprawdę pomocne ze względu na czas i zasoby pracy.

"Wykorzystanie jednej próbki jest zasadniczo powodem, dla którego zaprojektowaliśmy nasze protokoły w Hygiena, aby mieć usprawniony przepływ pracy, w którym próbka może być skonfigurowana raz, aby uzyskać zarówno wyniki kwantyfikacji, które mówią mi, czy moja próbka jest pozytywna z wysokim ryzykiem, lub alternatywnie jest negatywna i muszę kontynuować prewalencję, aby zarządzać ryzykiem regulacyjnym. Wartość kwantyfikacji nie powinna zakłócać normalnych procesów. Jeśli dodają Państwo więcej zasobów i więcej kosztów lub pracy, czy jest to naprawdę wartość dodana? Dane są nadal bardzo cenne, ale jeśli są tak trudne do zebrania ze względu na proces, stają się zaporowe. Musimy mieć dynamiczne dane liczbowe, a nie tylko jedynki i zera lub plusy i minusy".

Jeśli nie będzie to tak łatwe do zrobienia w laboratorium, branże i firmy mogą popaść w minimalną częstość występowania, co nie jest tym, czego potrzebujemy dla bezpieczeństwa żywności.

Wskazówka 5

"Ostatnią wskazówką jest zapoznanie się z danymi".

W przypadku każdej metody udowodnienie sukcesu za pomocą danych z walidacji lub weryfikacji jest tak ważne, aby upewnić się, że dostawcy i twórcy metod dołożyli należytej staranności.

"Piękno stosowania PCR do kwantyfikacji polega na tym, że testy zostały już zwalidowane pod kątem podstawowego składnika wykrywania patogenu na poziomie 1 CFU / próbkę w celu określenia częstości występowania, co jest trudniejsze niż kwantyfikacja. Ponieważ wszystkie pola zostały już sprawdzone pod kątem włączenia i wyłączności, wszystko, co robimy, to dodanie kwantyfikacji przy użyciu już ustalonych narzędzi mikrobiologicznych".

Powinni Państwo nie tylko zobaczyć dane, ale naprawdę zrozumieć ich ilość oraz sposób ich gromadzenia i porównywania. Samo opracowanie lub walidacja przy użyciu 10 próbek nie wystarczy, co najmniej 30 próbek zapewnia istotność statystyczną i zaufanie do porównań z metodami referencyjnymi, ale jest to absolutne minimum.

Podsumujmy

Sposób, w jaki myślimy o kwantyfikacji i przyczynach wszystkich tego rodzaju pytań i komentarzy, które można usłyszeć w branży i w rządzie, polega na upewnieniu się, że mają Państwo własne informacje i świadomość.

"Wykorzystanie pojedynczej próbki jest zasadniczo powodem, dla którego zaprojektowaliśmy nasze protokoły w Hygiena, aby mieć usprawniony przepływ pracy, w którym próbkę można skonfigurować raz, aby uzyskać oba wyniki kwantyfikacji, które powiedzą mi, czy moja próbka jest pozytywna z wysokim ryzykiem, czy też jest negatywna i muszę kontynuować prewalencję, aby zarządzać ryzykiem regulacyjnym. Wartość kwantyfikacji nie powinna zakłócać normalnych procesów. Jeśli dodają Państwo więcej zasobów i więcej kosztów lub pracy, czy jest to naprawdę wartość dodana? Dane są nadal bardzo cenne, ale jeśli są tak trudne do zebrania ze względu na proces, stają się zaporowe. Musimy mieć dynamiczne dane liczbowe, a nie tylko jedynki i zera lub plusy i minusy".

Jeśli nie będzie to tak łatwe do zrobienia w laboratorium, branże i firmy mogą ograniczyć się do minimalnej częstości występowania, co nie jest tym, czego potrzebujemy dla bezpieczeństwa żywności.