Explicado por expertos: Los 5 mejores consejos para la cuantificación que debe conocer

Bienvenidos a la primera serie "Explicado por expertos" con la directora de productos globales de MDx, April Englishbey.

Entremos de lleno y aprendamos sobre la cuantificación.

"He estado a bordo de la cuantificación y lancé comercialmente el primer método (o kit) de cuantificación siendo SalQuant™, y he estado a lo largo de todo el viaje. Por lo tanto, quería compartir algunas experiencias y atributos como cliente, lo que debe buscar para preguntar a su proveedor sobre la cuantificación.

Como alguien con experiencia práctica en el desarrollo de la cuantificación para la industria, quería compartir los componentes críticos que tenemos en cuenta cuando iniciamos el desarrollo de cualquier tipo de cuantificación, así como la forma en que funciona para que la industria cumpla en última instancia el objetivo de reducir el riesgo para el consumidor."

Consejo 1

"El número uno es la flexibilidad de los datos. Con los datos que pretende capturar y utilizar, piense qué es lo que realmente quiere saber. Cuando obtiene un resultado de 5,7 UFC por gramo, ¿cómo lo utiliza realmente como herramienta de toma de decisiones? Este es parte del descubrimiento consultivo que realizamos con los clientes para llegar a la raíz de cómo necesita utilizar la información adicional."

Conocer la respuesta a estas preguntas le ayuda a decidir cuál de los dos cubos de cuantificación necesita en función de la flexibilidad y el propósito de los datos.

La cuantificación real, como SalQuant, utiliza un punto de tiempo de incubación identificado junto con un software para determinar el número de bacterias en la muestra original.
Las pruebas de límites simplemente identifican cuando se produce un positivo en un punto de tiempo especificado, lo que indica que el número de bacterias es superior al umbral que se ha establecido. A veces, este estilo de pruebas también se conoce como semicuánticas, pero las pruebas de límites y umbrales son un poco menos confusas.

Comprender realmente qué tipo de datos está buscando y cómo tomaría una decisión utilizando esos datos es realmente importante. A fin de cuentas, ¿tiene el método que está utilizando la flexibilidad de utilizar una sola muestra o protocolo para realizar pruebas de cuantificación o de límites?

Consejo 2

"La segunda herramienta son las opciones de matriz dinámica.

La seguridad alimentaria no se limita a los productos finales, la mayoría de las veces esas muestras son las que reciben la mayor atención. Sin embargo, el procesado y la precosecha forman parte de la ecuación de la que también hay que preocuparse para gestionar todo el ámbito de la seguridad alimentaria.

Cuando comenzamos este viaje hace 3 años, primero desarrollamos la cuantificación para los productos finales y obtuvimos grandes datos, PERO aún necesitábamos averiguar por qué las bacterias seguían sobreviviendo después de todas las intervenciones aplicadas a lo largo del proceso.

Si podemos limpiar en la fase inicial de la producción animal y alimentaria tendremos más posibilidades de eliminar la Salmonella en todo el proceso y reducir ese riesgo. Por eso podemos ver que las industrias y las personas influyentes no sólo recopilan datos del producto final, sino que añaden puntos de datos coherentes a lo largo de sus procesos y evalúan realmente si las intervenciones están funcionando. También seguimos trabajando hacia atrás, hasta la granja o los niveles previos a la cosecha, para medir dónde podemos influir en la carga de salmonela que entra y la que sale."

Buscamos proveedores que tengan la robustez en su método para trabajar a través de variedades de matrices e incluso las muestras sucias como los enjuagues rehang versus los enjuagues post-refrigeración, ambos siguen siendo enjuagues, pero verificando que el método funciona debido a la naturaleza de la "suciedad".

No todas las muestras son iguales aunque tengan un aspecto similar, por lo que es importante asegurarse de que se han realizado comprobaciones para ver los datos por sí mismo.

Consejo 3

"El número tres es el rango enumerable más amplio.

Los métodos tienen que ser capaces de llegar tanto al extremo inferior (1 UFC) como al extremo superior (10.000 UFC) del rango de cuantificación porque necesitamos flexibilidad en función del tipo de muestra, así como cuando se produce un fallo crítico en el que las bacterias florecen sin control".

Dentro de los programas de seguridad alimentaria, sabemos que a veces habrá un valor atípico (bajo o alto) y el método tiene que ser capaz de cuantificar en comparación con informar de un rango negativo o superior al enumerable, que no es un punto de datos útil.

"Me gusta utilizar el ejemplo del aclarado, como mencioné en el consejo 2, para que el control del proceso vaya de sucio a limpio. Poder cuantificar que antes de la intervención hay un número elevado de bacterias y que después de la intervención sigue habiendo un positivo pero en una cantidad muy baja sabiendo que sigue siendo detectable y cuantificable es importante para medir realmente la eficacia del proceso y de las intervenciones."

Es realmente importante entender que lo que se espera de un producto final es que esté lo más limpio y la mayoría de las veces libre de patógenos. Los resultados no deben situarse en niveles elevados como 100 UFC/g o mL. Incluso 10 UFC/g puede ser demasiado alto dependiendo de la industria. Los métodos que tienen un extremo inferior de sólo cuantificar 100 UFC/g realmente no son útiles en un producto final porque el usuario tendrá una falsa sensación de "limpieza" cuando la cuantificación se vea como negativa.

Consejo 4

"El cuarto consejo es que el proceso debe ser fácil de usar".

Desde una perspectiva reguladora, la prevalencia siempre será un componente crítico para medir el riesgo para el consumidor, la cuantificación no pretende sustituir totalmente a la prevalencia. Es más bien un valor añadido. Cuando se piensa en el proceso de necesitar cumplir las necesidades normativas pero también recopilar más información, utilizar la misma muestra durante todo el proceso es realmente útil para los recursos de tiempo y mano de obra.

"Utilizar una sola muestra es esencialmente la razón por la que diseñamos nuestros protocolos en Hygiena para tener un flujo de trabajo racionalizado en el que la muestra se pueda configurar una vez para obtener ambos resultados de cuantificación, que me digan si mi muestra es positiva con un alto riesgo, o alternativamente es negativa y necesito continuar con la prevalencia para gestionar el riesgo reglamentario. El valor de la cuantificación no debe perturbar los procesos normales. Si está añadiendo más recursos y más costes o mano de obra, ¿es realmente un valor añadido a fin de cuentas? Los datos siguen siendo muy valiosos, pero si es tan difícil reunirlos debido al proceso, se vuelven prohibitivos. Necesitamos que los datos dinámicos sean datos numéricos frente a los simples unos y ceros o los positivos y negativos".

Si no es tan fácil hacerlo en el laboratorio, las industrias y las empresas podrían volver a limitarse a hacer el mínimo de prevalencia, que no es adonde tenemos que ir para la seguridad alimentaria.

Consejo 5

"El último consejo es ver los datos".

Para cualquier método, demostrar el éxito con datos procedentes de validaciones o verificaciones es muy importante para garantizar que los proveedores y los desarrolladores del método han actuado con la diligencia debida.

"Lo bueno de utilizar la PCR para la cuantificación es que los ensayos ya han sido validados para el componente central de detectar el patógeno a un nivel de 1 UFC/muestra para la prevalencia, que es más difícil que la cuantificación. Dado que ya se han comprobado todas las casillas para la inclusividad y la exclusividad, todo lo que estamos haciendo es añadir la cuantificación utilizando herramientas ya establecidas para la microbiología."

No sólo hay que ver los datos, sino entender realmente la cantidad de datos y cómo se han recogido y comparado. Sólo desarrollar o validar utilizando 10 muestras no es suficiente, como mínimo 30 muestras crea relevancia estadística y confianza en las comparaciones con los métodos de referencia, pero eso es un mínimo absoluto.

Recapitulemos

La forma en que pensamos sobre la cuantificación y las razones detrás de todo este tipo de preguntas y comentarios que puede escuchar en la industria y en el gobierno es asegurarse de tener su propia información y conciencia informadas.